И так для того что бы настроить пользователям сканирование на терминальной ферме, нам нужно создать новую коллекцию для сканирования, соответственно сервер должен быть на windows server 2012 или 2012 R2.
Далее нам нужно создать свои папки драйверов для сканеров, у меня использовались в основном МФУ компании HP, про другие модели не чего не скажу, ну думаю принцип тот же, поясню как создать свой драйвер пак для сканера HP LaserJet 1536 mfp.